Setelah Amagami SS, siswa SMA Junichi Tachibana melanjutkan hubungannya dengan gadis-gadis di sekolahnya. Amagami SS+ Plus menawarkan sekilas apa yang terjadi setelah penyelesaian kisah individu masing-masing gadis.
Peristiwa baru mulai terjadi antara masing-masing gadis dan Junichi. Tsukasa Ayatsuji, perwakilan kelas, mencalonkan diri sebagai ketua OSIS; Rihoko Sakurai, yang telah mengambil alih Klub Teh bersama Junichi, masih ingin menyatakan perasaannya padanya; Ai Nanasaki mempertanyakan masa depan hubungannya dengan Junichi ketika dia berangkat kuliah; Kaoru Tanamachi bertanya-tanya apakah hubungannya dengan Junichi akan berlanjut lebih jauh; Sae Nakata dan Junichi menghadapi teman sekelasnya yang masih tidak percaya bahwa seseorang yang begitu manis adalah pacarnya; dan Haruka Morishima ingin membawa hubungan mereka ke level selanjutnya dan menikah.
[Ditulis oleh MAL Penulisan Ulang]
